Die Leibniz-Gemeinschaft beherbergt 86 deutsche Forschungsinstitute, darunter das Bernhard-Nocht-Institut in Hamburg und das Forschungszentrum Borstel. Zu den größten Einrichtungen zählt das Kieler Institut für Meeresforschung (Geomar) mit 715 Mitarbeitern, darunter 370 Wissenschaftler. Der Gesamtetat beträgt 1,3 Milliarden Euro.

Die Helmholtz-Gemeinschaft ist als Verbund von 16 Großforschungseinrichtungen die führende Wissenschaftsorganisation in Deutschland. Zu den Mitgliedern gehören das Deutsche Elektronen-Synchrotron (Desy) in Hamburg und die GKSS in Geesthacht. Die Helmholtz-Einrichtungen haben 30 000 Mitarbeiter und einen Gesamtetat von drei Milliarden Euro.