Im Hafen ansässige Unternehmen setzen bereits seit Jahren zahlreiche Maßnahmen um, damit die Luftqualität im Hafen besser wird. Dazu zählen etwa die 14 Windräder, die im Hafengebiet umweltfreundlichen Strom produzieren. Außerdem bauen die beiden Hafenbetreiber HHLA und Euro­gate die Elektromobilität auf ihrem Gelände kontinuierlich aus. Derzeit tauscht die HHLA auf dem Containerterminal Altenwerder (CTA) ihre Automatic-Guided-Vehicles (AGV) gegen eine Öko-Variante aus.

Die transpondergeführten Transportfahrzeuge bewegen die Container automatisch zwischen Lager und Kaikante. Einen Meilenstein für die Energieversorgung von Containerschiffen im Hafen hat das Hamburger Unternehmen Becker Marine Systems präsentiert. Mobile LNG-Kraftwerke in Containerform sorgen dafür, dass die Hilfsdiesel an Bord abgeschaltet bleiben können. Diesem Zweck dient auch die Landstromanlage in Altona, an der etwa Kreuzfahrtschiffe andocken können.