Schleswig-Holstein besitzt den größten Wattenmeer-Nationalpark und nach Angaben der Verwaltung sogar den „größten Nationalpark zwischen Nordkap und Sizilien“. 441.500 Hektar sind seit 1985 unter Schutz gestellt (fast 98 Prozent Wasserflächen). Sitz der Nationalparkverwaltung ist Tönning.
Niedersachsen hat sein Schutzgebiet nach dem Gründungsjahr 1986 in den Jahren 2001 und 2010 erweitert auf jetzt 345.000 Hektar. 94,5 Prozent sind Meeresfläche (40 Prozent Watt, 54,5 Prozent Wasser), 5,5 Prozent Festland und Inseln. Die Verwaltung sitzt in Wilhelmshaven.
HamburgsWattenmeer-Nationalpark ist mit seinen 13.750 Hektar der kleinste im Nationalpark-Trio. Doch auf diesem Gebiet hat auf mehr als 90 Prozent der Fläche die Natur freien Lauf. Nur auf der Insel Neuwerk und in einem kleinen Seegebiet nordöstlich der Insel, in dem Krabben gefangen werden dürfen, beeinflussen menschliche Nutzungen die natürliche Dynamik.