Maria Jepsen wurde am 19. Januar 1945 als Maria Bregas im schleswig-holsteinischen Bad Segeberg geboren. Nach dem Studium in Tübingen, Marburg und Kiel übernahm sie 1972 eine Pfarrstelle in Meldorf (Dithmarschen), fünf Jahre später in Leck (Nordfriesland).

Als erste Frau in der damaligen Nordelbischen Kirche wurde sie 1991 Pröpstin im Kirchenkreis Hamburg-Harburg.

18 Jahre lang übte sie von 1992 an das Bischofsamt aus – so lange wie keiner ihrer Amtsvorgänger.