Für die medizinische Versorgung der Kinder gibt es vier Kliniken:
Die Kinderklinik des UKE und das Altonaer Kinderkrankenhaus, das ebenfalls zum UKE gehört, bilden einen Verbund. 2014 wurden im UKE knapp 6500 Kinder stationär behandelt, im AKK waren es 11.500.
Das Katholische Kinderkrankenhaus Wilhelmstift in Rahlstedt im Nordosten Hamburgs behandelt etwa 11.000 Patienten pro Jahr stationär.
Die Kinderklinik in der Asklepios Klinik Nord am Standort Heidberg kümmert sich um die kleinen Patienten im Norden der Hansestadt. In dieses Krankenhaus werden etwa 2500 Kinder pro Jahr aufgenommen und versorgt.